南京大学医学院附属鼓楼医院自1917年起开设五官科，1952年眼科独立分科。现有医技人员38名，其中主任医师6名，副主任医师8名；博士8名，硕士13名；教授、副教授2名；博/硕士生导师2名。目前床位45 张，手术室5间。

1984年眼科在国内依次开展放射状角膜切开技术治疗近视。1992年，在国内依次开展了小切口手法碎核白内障摘除人工晶体植入术；并多次在国外、国内学术会议上交流和手术演示，多次获得学术界和政府的奖状和奖励。

眼科现有亚太地区眼外伤协会会员1名，中华医学会眼科分会眼外伤学组委员1名，中国医师协会眼外伤专业委员会委员1名，江苏省医学会眼科分会委员3名，其中常委1名，江苏省医师协会眼科分会委员3名，其中常委1名。

《中华眼外伤职业眼病杂志》编委1名、《中华实验眼科杂志》通讯编委1名。目前眼科具有以下专业检查和治疗设备：蔡司手术显微镜、玻切超乳一体机、全飞秒激光机、超声乳化仪、3D手术系统、光相干断层扫描仪（OCT）、血流OCT（OCTA）、眼底荧光血管造影、脉络膜血管造影、全自动视野计、超广角眼底照相（欧宝）、电生理、A/B超、超声生物显微镜（UBM）、IOL-master、角膜地形图、角膜内皮计数仪、干眼检查仪、激光脉冲干眼治疗仪、综合验光仪等。

目前承担南京大学医学院、南京医科大学、南京中医药大学等高校眼科学理论教学及临床实践工作，是南京大学、南京医科大学、徐州医科大学的眼科学博士、硕士生培养点，也是国家眼科住院医师规范化培训基地。