上海仁济医院眼科是上海交通大学医学院眼科博（硕）士授予权学科、博士后流动站、上海市眼科专科医师规范化培训基地、上海市眼科住院医师规范化培训基地、国家眼科药物临床试验基地，也是上海医师协会眼科分会副会长单位、上海视光学会主任委员单位、上海眼底病学组组长单位、上海眼科学会小儿眼病及斜弱视学组副组长单位、上海交通大学医学院眼科视觉科学研究所副所长单位、上海交通大学医学院眼科系副主任单位。

科室在仁济东院、西院、南院皆有建制，均设有独立单元门诊和住院手术病房，共拥有医务工作者40余名，其中绝大多数医师获得博（硕）士学位。 科室常规开展角膜移植手术、玻璃体视网膜手术、白内障超声乳化手术、各种斜视手术、泪道手术、激光角膜屈光手术、青光眼手术等，拥有全配的Constellation超声乳化玻璃体切割一体机、歌德S4超声乳化玻璃体切割一体机、泪道内窥镜诊疗系统、多波长眼底激光机、炫彩OCT、准分子激光机、YAG+SLT激光机、泪道KTP激光机、视网膜脉络膜血管造影仪、角膜地形图分析系统等多种专业的检查治疗设备。 近几年，仁济眼科门急诊量（2014年12万人次）和住院手术量（2014年4300例）逐年递增，且大多数是三四级重点手术和日间手术，白内障手术量位于上海公立医院前列；而住院天数和药占比则逐年递减。发表SCI论文数、承担科研课题数以及招收的各类研究生、规培生数逐年增多。 

曾先后承担国家自然科学基金、上海市科委基金、上海市教委基金、卫生局基金等课题多项，获得国家卫生部科技成果奖、上海市科技进步奖等奖项多项。科室多名医师在全国、上海市等眼科学术组织、学术期刊任职。 2013年底成功召开第四届上海交通大学医学院视觉科学研究所学术论坛。 2014年6月成功举办第18个以“关注眼健康，预防糖尿病致盲”为主题的全国爱眼日科普主题活动。 2014年底成功召开上海交通大学医学院附属仁济医院眼科高峰论坛暨上海眼底病学组研讨会、“前后节联合手术新进展”学习班。 荣获上海交通大学医学院2013-2014文明班组。 荣获2014年仁济医院优秀党支部。 2015年底举办第三届上海交通大学仁济眼科高峰论坛、第七届上海交通大学医学院眼科视觉科学研究所高峰论坛、专业级继教项目“眼前后节联合手术新进展”学习班暨上海眼科学会眼底病学组研讨会